Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms