Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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