Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms