Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms