Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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