Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms