Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctnna3Q65CL1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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