Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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