Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms