Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PcolceQ61398 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PcolceQ61398 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PcolceQ61398 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PcolceQ61398 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PcolceQ61398 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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