Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms