Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nom1Q3UFM5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms