Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Samd11Q1RNF8 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Samd11Q1RNF8 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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