Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem52bQ0VBF2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms