Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms