Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms