Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms