Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VhlP40338 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms