Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
Defa5P28312 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms