Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P20040 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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