Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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