Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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