Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Defa35E9QLQ1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms