Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Myo5cE9Q1F5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Myo5cE9Q1F5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Myo5cE9Q1F5 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Myo5cE9Q1F5 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Myo5cE9Q1F5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myo5cE9Q1F5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms