Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP3

Spdef, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdefQ9WTP3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SpdefQ9WTP3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SpdefQ9WTP3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SpdefQ9WTP3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms