Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms