Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms