Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms