Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3bQ9CZT8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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