Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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