Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms