Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Abcf3Q8K268 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Abcf3Q8K268 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Abcf3Q8K268 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Abcf3Q8K268 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Abcf3Q8K268 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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