Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms