Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms