Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms