Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms