Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Dsg1bQ7TSF1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Dsg1bQ7TSF1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Dsg1bQ7TSF1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Dsg1bQ7TSF1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Dsg1bQ7TSF1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Dsg1bQ7TSF1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Dsg1bQ7TSF1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Dsg1bQ7TSF1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Dsg1bQ7TSF1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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