Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms