Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms