Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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