Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms