Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Trbv2-201ENSMUST00000103263 560 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr979-201ENSMUST00000080835 1045 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms