Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms