Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pde1bQ01065 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms