Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms