Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Cldn18P56857 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn18P56857 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn18P56857 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn18P56857 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn18P56857 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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