Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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