Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BgnP28653 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BgnP28653 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BgnP28653 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BgnP28653 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BgnP28653 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
BgnP28653 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BgnP28653 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
BgnP28653 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BgnP28653 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BgnP28653 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BgnP28653 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BgnP28653 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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