Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pde6aP27664 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pde6aP27664 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pde6aP27664 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pde6aP27664 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pde6aP27664 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pde6aP27664 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pde6aP27664 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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