Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ntf3P20181 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ntf3P20181 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ntf3P20181 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ntf3P20181 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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